В конце 1993 года Президент России подписал Указ о предоставлении особых льгот Национальному фонду спорта — структуре, существовавшей к тому моменту всего около года. Созданный для поддержки российского спорта, НФС получил беспрецедентные таможенные и налоговые льготы: ему было разрешено практически беспошлинно ввозить в страну алкогольную продукцию и сигареты и при этом не платить налоги со своих сверхприбылей. Подобные хозяйственные преференции имела только Русская православная церковь.
Инициатор создания НФС — Шамиль Тарпищев, личный тренер Президента Ельцина и по совместительству в то время — глава Министерства физкультуры и спорта, бразды правления которым он в 94-м году передал, как тогда казалось, своему другу Борису Федорову. Ходили слухи, что на аналогичные льготы претендовал в свое время и друг всех спортсменов Отари Квантришвили — одна из главных теневых фигур Москвы начала 90-х.
Обороты вокруг торговой сети НФС вскоре стали исчисляться сотнями миллионов долларов. Вместе с другими спортивными организациями НФС в течение буквально нескольких месяцев заключил около 140 контрактов на ввоз подакцизных товаров, по которым «списанная» сумма таможенных платежей, точнее, неплатежей, составила 3,7 млрд. долларов. Ситуация сложилась очень тревожная. Почему? Потому что безналоговый ввоз товаров в Россию наносил огромный ущерб федеральному бюджету. Но, возможно, это даже не самое главное. Важнее другое: целые отрасли российской промышленности оказались полностью лишенными таможенной защиты. Это ликероводочная промышленность, винодельческая, автомобилестроение и многие другие.
В целом за 1994 год потери федерального бюджета только от непоступления таможенных платежей достигли примерно 1 трлн. рублей. Доходы же НФС от импортных операций, по оценкам Счетной палаты, составили примерно 100-200 млрд. рублей — то есть намного меньше, чем потери бюджета. В реальности же за счет этого «околоспортивного» бизнеса наживались теневые структуры: криминальные дельцы оперировали «черным налом». Импортный алкоголь ввозился в страну без всяких пошлин и вытеснял с рынка отечественного производителя.
Причем при всех огромных доходах столь крупного бизнеса практически никакого позитивного эффекта на состояние отечественного спорта он не оказывал.
Когда у НФС стали отбирать льготы, а происходило это постепенно, пролилась первая кровь. В марте 1995 года пули настигли эксперта дирекции внешнеэкономической деятельности НФС Льва Гаврилина, который являлся и членом оргкомитета Игр доброй воли.
Через год начались проблемы у руководителя НФС и банка «Национальный кредит» Бориса Федорова. Вначале его арестовали за то, что в бардачке автомобиля обнаружили несколько граммов кокаина, но освободили, когда Федоров был смещен со своего поста в НФС.
Его преемником стал полковник антикоррупционного отдела Службы безопасности президента, бывший начальник одного из отделов Московского уголовного розыска Валерий Стрелецкий — ближайший сподвижник Александра Коржакова, тогдашнего всесильного руководителя Службы безопасности Ельцина.
Проблемы же Федорова, как оказалось, только начинались: спустя две недели на него совершили покушение. Киллер сумел выпустить только одну пулю — на второй пистолет заклинило. Тогда Борису нанесли четыре ножевых ранения в шею и грудь. После излечения он был возвращен на руководящую должность в НФС, но уже на должность вице-президента.
Федоров оказался в эпицентре информационной войны. В разгар предвыборной гонки 1996 года была предана огласке пленка аудиозаписи его беседы с членами ельцинского избирательного штаба, где он дает исчерпывающую характеристику своему бывшему коллеге и покровителю — министру физкультуры и спорта Шамилю Тарпищеву и его высокопоставленным друзьям. Федоров обвинил Коржакова, Барсукова и Тарпищева в коррупции и вымогательстве, а также обличил последнего в связях с Тайванчиком, «авторитетами» Измайловской группировки и другими.
В 1999 году Федоров в возрасте 40 лет скоропостижно скончался от острой сердечной недостаточности при странных обстоятельствах.
После выборов 1996 года наступил относительный политический штиль, и такую засветившуюся структуру, как НФС, нужно было тихонько уводить в тень.
Не случайно бывший заместитель руководителя Счетной палаты Юрий Болдырев считает, что это чуть ли не самое крупное «нарушение» того периода ельцинской эпохи. Всего, по его словам, в 1995 году из Федерального бюджета через спортивные организации утекло за счет таможенных неплатежей свыше 37 трлн. рублей (тогда это было свыше 9 млрд. долларов), из них 32 трлн. рублей прошли через Национальный фонд спорта.